Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dkk3Q9QUN9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dkk3Q9QUN9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms