Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdkl2Q9QUK0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdkl2Q9QUK0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms