Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Irx5Q9JKQ4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx5Q9JKQ4 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms