Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ctnnbip1Q9JJN6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms