Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHL1

Slc9a3r2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3r2Q9JHL1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc9a3r2Q9JHL1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a3r2Q9JHL1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a3r2Q9JHL1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a3r2Q9JHL1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a3r2Q9JHL1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a3r2Q9JHL1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a3r2Q9JHL1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a3r2Q9JHL1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a3r2Q9JHL1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a3r2Q9JHL1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a3r2Q9JHL1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a3r2Q9JHL1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a3r2Q9JHL1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a3r2Q9JHL1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc9a3r2Q9JHL1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a3r2Q9JHL1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a3r2Q9JHL1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a3r2Q9JHL1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a3r2Q9JHL1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a3r2Q9JHL1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a3r2Q9JHL1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a3r2Q9JHL1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a3r2Q9JHL1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a3r2Q9JHL1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a3r2Q9JHL1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc9a3r2Q9JHL1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms