Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Pgpep1Q9ESW8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Pgpep1Q9ESW8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Pgpep1Q9ESW8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Pgpep1Q9ESW8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Pgpep1Q9ESW8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Pgpep1Q9ESW8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Pgpep1Q9ESW8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Pgpep1Q9ESW8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Pgpep1Q9ESW8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Pgpep1Q9ESW8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Pgpep1Q9ESW8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms