Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SyncQ9EPM5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SyncQ9EPM5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms