Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnft1Q9DCN7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms