Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cbx6Q9DBY5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cbx6Q9DBY5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms