Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tm9sf1Q9DBU0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tm9sf1Q9DBU0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms