Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SrpraQ9DBG7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms