Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TrmuQ9DAT5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TrmuQ9DAT5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms