Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tmem239Q9DA47 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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