Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbe1Q9D6Y9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbe1Q9D6Y9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms