Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc94Q9D6J3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc94Q9D6J3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms