Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9D5Q8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms