Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc83Q9D4V3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc83Q9D4V3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms