Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
4931428L18RikQ9D4S9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4931428L18RikQ9D4S9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms