Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clvs1Q9D4C9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clvs1Q9D4C9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms