Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Chordc1Q9D1P4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms