Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mis12Q9CY25 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms