Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4931417E11RikQ9CR05 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4931417E11RikQ9CR05 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms