Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rer1Q9CQU3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms