Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Smim8Q9CQQ0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Smim8Q9CQQ0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms