Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nicn1Q9CQM0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nicn1Q9CQM0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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