Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Higd2aQ9CQJ1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Higd2aQ9CQJ1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms