Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76

Nepn, Nephrocan, mousemouse

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Length 512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NepnQ9CQ76 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
NepnQ9CQ76 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NepnQ9CQ76 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms