Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ska1Q9CPV1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms