Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd3Q99PL7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms