Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lysmd3Q99LE3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lysmd3Q99LE3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms