Protein–RNA interactions for Protein: Q99K51

Pls3, Plastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls3Q99K51 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pls3Q99K51 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pls3Q99K51 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pls3Q99K51 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pls3Q99K51 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pls3Q99K51 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pls3Q99K51 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pls3Q99K51 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pls3Q99K51 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pls3Q99K51 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pls3Q99K51 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pls3Q99K51 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pls3Q99K51 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pls3Q99K51 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pls3Q99K51 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pls3Q99K51 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pls3Q99K51 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pls3Q99K51 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pls3Q99K51 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pls3Q99K51 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pls3Q99K51 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pls3Q99K51 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pls3Q99K51 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pls3Q99K51 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pls3Q99K51 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pls3Q99K51 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pls3Q99K51 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pls3Q99K51 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pls3Q99K51 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pls3Q99K51 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pls3Q99K51 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Pls3Q99K51 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pls3Q99K51 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pls3Q99K51 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pls3Q99K51 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Pls3Q99K51 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pls3Q99K51 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pls3Q99K51 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms