Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ddb2Q99J79 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ddb2Q99J79 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ddb2Q99J79 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ddb2Q99J79 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ddb2Q99J79 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ddb2Q99J79 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ddb2Q99J79 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ddb2Q99J79 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ddb2Q99J79 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ddb2Q99J79 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddb2Q99J79 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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