Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Def8Q99J78 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Def8Q99J78 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms