Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM35BQ8NCS4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
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