Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hpf1Q8CFE2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Hpf1Q8CFE2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Hpf1Q8CFE2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Hpf1Q8CFE2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Hpf1Q8CFE2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hpf1Q8CFE2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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