Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CntrobQ8CB62 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CntrobQ8CB62 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CntrobQ8CB62 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CntrobQ8CB62 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CntrobQ8CB62 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CntrobQ8CB62 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CntrobQ8CB62 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CntrobQ8CB62 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CntrobQ8CB62 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CntrobQ8CB62 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CntrobQ8CB62 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CntrobQ8CB62 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CntrobQ8CB62 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CntrobQ8CB62 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CntrobQ8CB62 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CntrobQ8CB62 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CntrobQ8CB62 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CntrobQ8CB62 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms