Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW22

Ss18l1, Calcium-responsive transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l1Q8BW22 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ss18l1Q8BW22 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ss18l1Q8BW22 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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