Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSU2

Cxcl16, C-X-C motif chemokine 16, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl16Q8BSU2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Cxcl16Q8BSU2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cxcl16Q8BSU2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcl16Q8BSU2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms