Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rufy1Q8BIJ7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rufy1Q8BIJ7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms