Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cyp4f39Q8BGU0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cyp4f39Q8BGU0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms