Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpped1Q8BFS6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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