Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifna12Q80SS5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms