Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPZ3

Zc3h4, Zinc finger CCCH domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h4Q6ZPZ3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zc3h4Q6ZPZ3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zc3h4Q6ZPZ3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zc3h4Q6ZPZ3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zc3h4Q6ZPZ3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms