Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Wdr44Q6NVE8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr44Q6NVE8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms