Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cep290Q6A078 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cep290Q6A078 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cep290Q6A078 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Cep290Q6A078 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Cep290Q6A078 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep290Q6A078 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep290Q6A078 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep290Q6A078 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep290Q6A078 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep290Q6A078 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep290Q6A078 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep290Q6A078 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep290Q6A078 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cep290Q6A078 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Cep290Q6A078 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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