Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ctnna2Q61301 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ctnna2Q61301 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ctnna2Q61301 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ctnna2Q61301 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ctnna2Q61301 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ctnna2Q61301 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ctnna2Q61301 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ctnna2Q61301 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnna2Q61301 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnna2Q61301 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnna2Q61301 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnna2Q61301 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnna2Q61301 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnna2Q61301 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnna2Q61301 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnna2Q61301 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnna2Q61301 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnna2Q61301 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnna2Q61301 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnna2Q61301 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnna2Q61301 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnna2Q61301 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnna2Q61301 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ctnna2Q61301 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms