Protein–RNA interactions for Protein: Q60855

Ripk1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk1Q60855 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ripk1Q60855 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ripk1Q60855 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms