Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Specc1Q5SXY1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Specc1Q5SXY1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms