Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn1r196Q5SVD5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r196Q5SVD5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms