Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP45

5730522E02Rik, RIKEN cDNA 5730522E02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730522E02RikQ5SP45 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
5730522E02RikQ5SP45 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
5730522E02RikQ5SP45 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms